臺風(fēng)災(zāi)害防御由各級政府防汛指揮機(jī)構(gòu)統(tǒng)一組織指揮，實行各級人民政府行政首長負(fù)責(zé)制，統(tǒng)一指揮、分級分部門負(fù)責(zé)。

國務(wù)院設(shè)立國家防汛指揮機(jī)構(gòu)，由國務(wù)院有關(guān)部委、中央軍委總參謀部、武警部隊負(fù)責(zé)人等組成，負(fù)責(zé)領(lǐng)導(dǎo)、組織全國的防汛防臺風(fēng)工作，其辦事機(jī)構(gòu)設(shè)在水利部。長江、黃河、淮河、海河、珠江、松花江遼河、太湖等7 個國家重要河湖設(shè)立流域防汛指揮機(jī)構(gòu)，由流域內(nèi)有關(guān)省（自治區(qū)、直轄市）人民政府、水利部流域管理機(jī)構(gòu)負(fù)責(zé)人等組成，在國家防汛抗旱總指揮部辦公室領(lǐng)導(dǎo)下，指揮流域內(nèi)的防汛防臺風(fēng)工作，其辦事機(jī)構(gòu)設(shè)在相應(yīng)流域管理機(jī)構(gòu)。縣級以上地方人民政府設(shè)立防汛指揮機(jī)構(gòu)，由有關(guān)部門和單位、當(dāng)?shù)伛v軍、武警部隊負(fù)責(zé)人等組成，在上級防汛指揮機(jī)構(gòu)和本級人民政府領(lǐng)導(dǎo)下，指揮本地區(qū)的防汛防臺風(fēng)工作，其辦事機(jī)構(gòu)設(shè)在各級水利部門。